Зависит от плотности атмосферы (высоты). Стартующая РН Союз проходит высоту 20км на скорости ~900м/с, 35км -- 1500м/с. Связь не теряет. У спускаемого аппарата такая проблема есть -- у него и перегрузки выше, и нагрев сильнее. Точно по цифрам не скажу, но похоже, ГПВРД начинает работать примерно при тех же условиях, когда возникает плазменное облако.
Насчет антенну высунуть, думаю, от нее самой ударная волна будет еще та. Она ж сама тоже в потоке. И как ее охлаждать непонятно.
Пока в формулах копался, дошло -- у него же нормальный полет на высоте выше 20км, а до цели нужно снижаться на уровень моря. Сможет ли движок тянуть при таких изменениях давления? В свободном падении без тяги аппарат успеет скорость потерять в 2-3 раза, по любому. Так что в этом месте может и проблемы нет.
А вот с маневрирующей головой "Авангарда" что придумали, интересно. Если она в атмосфере рулит, и при этом пытается куда-то попасть, без наведения никак. Причем скорости там выше, по расчетам 2-3км/с может быть при ударе. И ведь решили же как-то.